فرآیند چاپ مقاله علمی با شناسایی یک مسئله پژوهشی یا سوال علمی آغاز می‌شود. پژوهشگر پس از مطالعه عمیق منابع و مقالات مرتبط، شکاف موجود در دانش را شناسایی کرده و برای پر کردن این شکاف، پژوهش خود را طراحی و اجرا می‌کند. مرحله بعدی، تجزیه و تحلیل داده‌ها و نتیجه‌گیری از یافته‌ها است.

نگارش مقاله یکی از مراحل حیاتی این فرآیند است. مقاله باید بر اساس ساختار استاندارد IMRaD (مقدمه، روش‌ها، نتایج و بحث) نوشته شود. چکیده مقاله باید به گونه‌ای نوشته شود که خلاصه‌ای جامع از کل مقاله را در برداشته و خواننده را به مطالعه全文 ترغیب کند. بخش مقدمه باید مسئله پژوهش، اهمیت آن و اهداف پژوهش را به وضوح بیان کند.

بخش روش‌ها باید به اندازه‌ای دقیق و کامل باشد که پژوهشگران دیگر بتوانند پژوهش را تکرار کنند. در بخش نتایج، یافته‌ها به صورت عینی و بدون تفسیر ارائه می‌شوند. بخش بحث نیز به تفسیر نتایج، مقایسه با یافته‌های دیگر پژوهش‌ها و بیان محدودیت‌های پژوهش می‌پردازد.

پس از تکمیل نگارش, مقاله برای مجله مناسب ارسال می‌شود. انتخاب مجله باید بر اساس حوزه تخصصی، ضریب تاثیر، زمان بررسی و نرخ پذیرش مجله انجام شود. پس از ارسال، سردبیر مجله مقاله را از نظر انطباق با اهداف و حیطه مجله بررسی می‌کند. اگر مقاله با معیارهای اولیه مجله مطابقت داشته باشد، برای داوری همتا ارسال می‌شود.

فرآیند داوری معمولاً بین چند هفته تا چند ماه طول می‌کشد. داوران که متخصصان حوزه مربوطه هستند، مقاله را از نظر اصالت، اهمیت، صحت روش‌ها و نتایج بررسی می‌کنند. آن‌ها نظرات خود را به صورت محرمانه برای سردبیر ارسال می‌کنند. سردبیر بر اساس نظرات داوران، یکی از تصمیمات زیر را اتخاذ می‌کند: پذیرش، پذیرش مشروط پس از اصلاحات، اصلاحات اساسی و ارسال مجدد، یا رد مقاله.